深夜アニメは、いくらヒットした作品があっても、なぜ短期間で終わることが多いのですか？

深夜アニメ枠は、アニメをつくってるプロダクションが、買い取って、自分たちの力で放映する。アニメ製作者がそのアニメの宣伝とおもって無料で放映する。という構造になっています。
　
そのことは、深夜アニメで制作にかかったお金を回収するために「ブルーレイディスク」や「アニメグッズショップのグッズ」を買ってくれという宣伝をしつっっっこく流していることからも明らかです。
そして、ディスクやグッズだけでは回収できなかった場合、残念ですが続編はつくれません。次のもっといい原作付アニメ（貢いでくれそうなファンがついているもの）をつくります。
　
もし稼げるアニメであれば、勝手にスポンサーがついて深夜でない時間帯に流せます（銀魂）
ネタがつきかけてきてるけどもうちょっとドカンと稼ぎたいときは劇場版などをつくり、ファンの映画興行収入を期待したり（Ｋ、攻殻）、ＯＶＡとして最初からディスクを買わないと続編がみられない形にします（トワノクオン、ガンダムユニコーン）。
　
ちなみにファンがついていても昼間にながせない＝売りにくいアニメとは、エロ、グロ、暴力、お金をだしてくれそうな全世代を極端に敵視するストーリー、ですが、ラノベはその要素を複数満たしている物が多いです。銀魂はジャンプにのせてるだけあって、上手く直接的なエログロ暴力は避けていますが、最初はいろいろ「夕方にやるんだから」という自粛要請などがあったようですよ。ゾーニングの問題ってこと。
　
　
なお、けっこうじわじわ続いてる深夜アニメには、Ｄ＆Ｄとか、ドッグデイズなどがあります。ディスクが売れたのでしょう。
また、カードゲームやアプリゲームでゲームユーザーがお金をおとしてくれるものは続編ができまくります（カードファイトバンガード、カンコレなど。大人でもお金を払います）
みんながユーチューブで違法アップロード物を無料で見てしまい、お金を払わないと、そのアニメの続編はできません。
ただ、今アニメ化されているアルすらーん戦記は２７年前。おじさんになってお金を払えるようになったファンをあてこんで再アニメ化もあり得ますから、がんばって発言力のある、お金もある、大人になってください。
今、そもそもテレビ放映がなぜか極端に少ない静岡県には、そういうアニメ好きの大人（スポンサー）がいないみたいですね。そういうところにはアニメ好き、コンピュータ好きの就職希望者たちはあつまらないとおもうのですけど。