一太郎形式（拡張子jtd）のファイルを書き出すWindowsプログラムの開発を検討しています。

一太郎のマクロはどうなの？
[032202]マクロを作成して操作を自動化したい

アンテナハウスのリッチテキストコンバータを使えばjtdを吐き出させる事ができます。
ただし、残念ながらパッケージソフトでライブラリではありません。
アンテナハウスはソフトのOEM供給もやっていますが、上記製品はOEM製品群では無いため、
購入ライセンス数が膨大な案件にならない限りライブラリ化などのカスタマイズ対応は困難と思います。
http://www.antenna.co.jp/rtc/function.html


質問の後半部分でおっしゃっているようにインストールされている一太郎を利用するのが現実的ではないかと思います。
　----- test.l -----
　(shell-command
　"c:/Progra~1/Justsystem/TARO15/taro15.exe /M/c:/temp/tarotest.txt")
　----- test.l -----

　----- tarotest.txt(マクロ本体) -----
　OpenDocument("c:\temp\tarotest\input.htm")
　SaveDocument("c:\temp\tarotest\output\output.jtd",,,0)
　Exit?()
　----- tarotest.txt -----
htmlだとjtd変換後のスタイルが崩れますね…