トロイの木馬に感染してしまいスキャンしたのですが脅威はないと言われました。それでも駆除したいのですがどうしたら良いでしょうか？ 教えてください

セキュリティ対策ソフトは何を使っていますか？
信頼できるソフトでスキャンして、「脅威はありません」のようなメッセージが表示されるのでしたら、感染していませんので駆除する事はできません。
セキュリティ対策ソフトが感染前に自動で対処したのだと思います。
対策ソフトのログ(※履歴)でスキャン結果などをもう一度確認してみてください。

※感染している事はどうやって確認したのでしょう？

ウイルスバスターで トロイの木馬をスキャン中 と出たのですが、脅威はないと言われました。

次のページにあるような画面でしょうか？

・[ウイルスバスター2012] ウイルスやスパイウェアをチェックする方法を教えてください。
http://www.fmworld.net/cs/azbyclub/qanavi/jsp/qacontents.jsp?rid=417&PID=6209-6995

スキャン中に進行バーの上に「トロイの木馬をスキャン中...」などと表示されるのは、スキャンの進行状態を示すメッセージです。
トロイの木馬に感染したわけではありません。
検索実行画面あるいは検索完了時に表示される検索結果の画面で「検出数」が「0」になっていれば感染はありません。
駆除の必要はありませんので、そのまま使用して大丈夫です。

・ウイルスバスタークラウド トロイの木馬をスキャンしています
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q10113100870


※もし感染するような心当たりがあって心配なのでしたら、他社のオンラインスキャン等でもスキャンしてみてください。(今は必要なくても、たまに思いついた時にでも試すようにするといいかもしれません。)

・カスペルスキー セキュリティ スキャン
http://www.kaspersky.co.jp/security-scan
※Win XP SP2以降に対応した無料ツールです。(現在利用している対策ソフトの他にインストールして併用可能)
※検知するだけで駆除はできません。

・F-Secure オンライン スキャナ
http://www.f-secure.com/ja/web/home_jp/online-scanner
※Win XP SP3以降に対応した無料オンラインスキャナです。
※検知だけでなく駆除も可能


以下のページでも各種オンラインスキャンサービスが紹介されています。(リンク切れもありますが・・・)

・オンラインスキャンによるクロスチェック
https://www.ccc.go.jp/flow/03/340.html