WEBサイト制作において、HTML、CSSコーディングの「WEB標準」と呼ばれる基準はどの様な部分なのでしょうか。

WEB標準の第一人者であるビジネスアーキテクツ森田氏の記事です。

http://web-tan.forum.impressrd.jp/e/2007/07/27/1638

状況や環境に左右されない、等価な情報伝達を実現する技術仕様。

だそうです。

Web標準仕様は厳密に定められているので、「使っていいタグ駄目なタグ」といった How to 的な情報は意味が無いと思います。

むしろ、実際に記述した HTML / CSS / XHTML を W3C の「Markup Validation Service」に通して、エラーを調べた方が覚えやすいでしょう。

W3Cの各種仕様の和訳は「W3Cの仕様書等の文書の日本語訳集」から調べることができます。

なお、アクセシビリティという観点からは、JIS X 8341-3 が規格化されています。

富士通のフリーソフト「WebInspector」を使って適合しているかどうか検査できます。

http://openlab.ring.gr.jp/k16/htmllint/htmllint.html

ここでチェックできますし、チェックする内容についてはここにかかれてます。

記述の仕方ではなく、運用の仕方ですよね？

コレは 「標準」 といったものはありませんが、良く使われるものとして

　　画像フォルダ → img

　　スタイルシートフォルダ → css

　　Javascript フォルダ → js

　　　　(css との連携がある場合は css に一緒に置かれる場合も)

などです。

ほかにも、カテゴリ分けされるような場合はディレクトリを分けたり、さらに下層へ掘ったりして分けるのも管理としてしやすいです。

重要なのが

業界としての基準が無いので、自分たちで名前の付け方、管理の仕方をキチンと付ける。

そして、一度決めたルールは滅多に変更しない

です

使っていいタグ、駄目なタグは HTML の strict であったり、XHTML の仕様にしたがって記述すれば大丈夫です。

W3C にて記述が正しいかどうか調べるツールがあるので、それを使って調べるといいとおもいます。

http://validator.w3.org/