日本家屋や料理屋、旅館などで上がる前に平たい多きな岩がありますが、あの上で靴を脱ぐのでしょうか？それとも靴を脱いであの岩にあがるのでしょうか？

あの上で靴を脱ぐ。

http://q.hatena.ne.jp/answer

アルバイトで仲居をやっていましたが、石の上で靴を脱がれるお客様の方が多かったです。

スリッパが置いてあれば、そのひとつ手前のところで脱げば間違いないと思います。

ただ、最近は靴を脱がずに部屋まで行く旅館も多いみたいです。

http://www.beppu-navi.jp/manual/japan/japanese.html

あれは沓脱石（くつぬぎいし）と言います。

昔の建物の多くは地面と玄関の上がり框（あがりかまち）の段差が

大きいので、平たい沓脱石の上で履物を脱ぎ、室内へ上がりやすいようにしました。

石の上に乗って室内に向かって脱ぎ、室内に上がってから振りかえって脱いだ靴の向きを整えます。

石の説明ですが。

http://www.sumainavi.net/column/col031209.html

あの上で靴を脱ぐのです。

岩の上はホコリが溜まりやすいので素足だと汚くなります。

http://q.hatena.ne.jp/